Грибы и бактерии участвуют в разложении органических остатков следующим образом:

Грибы разлагают лигнин, клетчатку, дубильные вещества, протеины. 1 Во внешнюю среду грибы выделяют ферменты и кислоты, которые участвуют в разрушении минералов. 1 Многоклеточные грибы образуют разветвлённый мицелий, нити которого пронизывают и укрепляют плодородный грунт, формируют его зернистую структуру. 1

Бактерии способны разлагать почти все органические соединения. 2 С помощью своих экзоферментов бактерии активно используют белок, простые сахара, крахмал, органические кислоты, спирты, альдегиды, разлагают клетчатку и углеводы с большой скоростью. 2

Аэробное разложение проходит в верхних слоях грунта и на хорошо разрыхлённой земле. 1 Оно приводит к полному распаду органики, выделению энергии. 1 Образуются минеральные вещества, доступные для растений. 1 Анаэробный распад характерен для затопленных участков, глубинных слоёв грунта. 1 Проходят брожение и неполный распад остатков растений с образованием сложных органических и минеральных соединений. 1