Гомозиготность влияет на чистоту признаков в селекции следующим образом: она способствует закреплению хозяйственно ценных признаков у потомков. 5

Например, при близкородственном скрещивании (инбридинге) в течение нескольких поколений гены переходят в гомозиготное состояние, что позволяет вывести чистые линии с желаемыми признаками. 35

Однако у такого процесса есть и недостатки: гомозиготизация ведёт к ослаблению организмов, снижает их устойчивость к воздействию среды и повышает заболеваемость. 5

Таким образом, гомозиготность важна для закрепления определённых признаков, но имеет и негативные стороны, которые необходимо учитывать при проведении селекционных работ.