Гипохромный эффект приводит к уменьшению поглощения света молекулой или соединением, обычно в ультрафиолетовом или видимом спектре света. 3
В случае нуклеиновых кислот гипохромный эффект проявляется в том, что поглощение ультрафиолетового излучения двухцепочечной ДНК значительно ниже, чем суммарное поглощение отдельных одиночных нитей. 3
Это связано с тем, что в двойной спирали азотистые основания расположены друг над другом стопкой (стэкинг) и взаимодействуют друг с другом. 4 Такое взаимодействие влияет на интенсивность поглощения света азотистыми основаниями: она уменьшается по сравнению с невзаимодействующими основаниями. 4
Гипохромный эффект обусловлен строго упорядоченным, параллельным расположением плоскостей гетероциклических колец оснований. 5