Ядерные поры обеспечивают обмен веществ между цитоплазмой и ядром клетки. 4 Переход молекул из ядра в цитоплазму и в обратном направлении называется ядерно-цитоплазматическим транспортом. 25

Процесс можно разделить на две категории: 2

1. Пассивный транспорт. 2 Молекулы небольших размеров (ионы, метаболиты, мононуклеотиды и т. д.) способны пассивно диффундировать в ядро. 2 Проводимость ядерных пор для молекул разных размеров различна. 2 Например, белки массой до 15 кДа быстро проникают в ядро, а для белка массой более 30 кДа на это требуется определённое время. 2 Белковые молекулы массой более 60–70 кДа, по-видимому, вообще не могут пассивно проходить через ядерные поры. 2
2. Активный транспорт. 2 Путём активного транспорта через ядерные поры могут проходить гораздо более крупные молекулы и целые надмолекулярные комплексы. 2 Так, рибосомные субъединицы размерами до нескольких мегадальтон транспортируются из ядра в цитоплазму через ядерные поры. 2

Чтобы более крупная белковая молекула прошла через ядерную пору, она должна быть помечена специальной аминокислотной последовательностью, которая называется «сигнал ядерной локализации» (nuclear localization signal (NLS)). 1 Белки кариоферины распознают эту последовательность, подхватывают помеченный ею субстрат и курсируют между ядром и цитоплазмой, перенося связанную молекулу в одном направлении: из цитоплазмы в ядро (импортины) или из ядра в цитоплазму (экспортины). 1