Фосфатные группы влияют на структуру нуклеиновых кислот следующим образом:

• Соединяют нуклеотиды в длинные цепочки. 4 Роль мостика между нуклеотидами выполняет 3',5'-фосфодиэфирная связь, соединяющая 5'-фосфат одного нуклеотида и 3'-гидроксил остатка рибозы (или дезоксирибозы) следующего. 2
• Сохраняют устойчивость нуклеиновых кислот. 4 Отрицательный заряд фосфатных групп не позволяет фосфатным эфирам подвергаться гидролизу и сохраняет устойчивость нуклеиновых кислот. 4
• Определяют кислотно-основные свойства. 3 В физиологических условиях среды (рН ~ 7,4) фосфатные группы в молекулах ДНК и РНК полностью ионизированы, поэтому в условиях внутренней среды живых организмов нуклеиновые кислоты существуют в форме полианионов, то есть несут множество отрицательных зарядов. 3