Фенотипическое расщепление при анализирующем скрещивании гибридов формируется следующим образом: если исследуемая особь с доминантными признаками гетерозиготна, то в потомстве будет расщепление по генотипу и фенотипу в соотношении 1:1. 25 Если же организм с доминантным фенотипом гомозиготный, то в этом случае при анализирующем скрещивании в поколении F1 не будет расщепления. 2
Это объясняется гипотезой «чистоты» гамет: при образовании гибридов аллельные гены не смешиваются, а остаются в неизмененном виде. 1 В результате мейоза гибриды образуют два типа гамет, в каждую из которых идёт одна из пары гомологичных хромосом с аллельным геном. 1 При оплодотворении восстанавливается гомологичность хромосом и аллельность генов, проявляется рецессивный признак, ген которого в гибридном организме не проявлял своего действия. 1