Фонология связана с другими разделами лингвистики, в частности с фонетикой и морфологией, следующим образом:

• С фонетикой фонология имеет общий объект изучения — звуковую сторону языка. 2 Фонетика исследует артикуляционно-акустическую сторону звучащей речи, а фонология рассматривает звуки с учётом их соотношений в системе языка и смыслоразличительной роли в речи, их функций в процессе общения. 2
• С морфологией фонология связана тем, что изучает фонемы, которые участвуют в построении и различении значимых единиц языка — морфем и слов. 3 Эти единицы служат для различения и отождествления морфем и слов, что важно для морфологии, которая изучает различные аспекты внутренней структуры слова. 4