Эволюция влияет на процессы эмбриогенеза у разных видов животных следующим образом: в индивидуальном развитии можно наблюдать предковые признаки (палингенезы) — например, образование у эмбрионов млекопитающих зародышевых листков, хорды, жаберных щелей и др.. 1
Однако в ходе эволюции появляются новые признаки — ценогенезы. 1 Например, образование провизорных, или внезародышевых, органов у рыб, птиц и млекопитающих. 1
Также существует теория филэмбриогенеза, согласно которой эволюционный процесс совершается не путём накопления изменений признаков взрослых животных, а путём суммирования изменений, появляющихся у зародышей. 2 Иными словами, перемена в условиях существования данного вида животных является стимулом к изменению его организации. 2