Эволюция влияет на потерю генов в Y-хромосоме следующим образом: из-за того, что у неё нет пары, она не может исправлять ошибки и стала меняться и эволюционировать очень быстро. 2 В результате гены, которые не дают преимущества или даже скорее вредят, постепенно исчезают. 5

Y-хромосома передаётся лишь от отца к сыну, а это значит, что гены в ней не могут комбинироваться, из-за чего накапливаются негативные мутации. 3 С каждым поколением они всё больше приводят к деградации этой хромосомы. 3

В процессе эволюции Y-хромосома человека потеряла большую часть изначально имевшихся в ней генов, и сейчас, по разным оценкам, содержит от 45 до 90 генов по сравнению с примерно 1400 генами на Х-хромосоме. 1