Эволюция повлияла на развитие сигнальных систем у живых организмов следующим образом:

• Создание сигнальных молекул ещё до появления животных. 1 Исследователи обнаружили, что химические предшественники двух важных нейромедиаторов, или сигнальных молекул, которые используются нервной системой, появились во всех основных группах животных, предшествовавших существам с центральной нервной системой. 1
• Изменение функциональности сигнальных молекул. 1 Предки хоанофлагеллятов производили белки, функциональное назначение которых позже, с появлением нервных систем первых животных, стало иным. 1
• Создание основы для мышления и языка. 5 Эволюция привела к обретению мозгом способности к вычислению, использованию рекурсивных правил и ментальных репрезентаций, что создало основу для мышления и языка в человеческом смысле. 5