Эволюция млекопитающих привела к ряду изменений в развитии их внутренних систем органов, среди которых:

• Опорно-двигательная система. 14 Произошло увеличение крестцового отдела позвоночника, усилилась связь между крестцовыми позвонками и костями таза, что повысило эффективность работы задних конечностей. 1 Изменилось положение конечностей: они стали вертикальными, что оптимизировало их работу при передвижении на суше. 1
• Нервная система. 24 Совершенствовалась, в первую очередь в направлении развития головного мозга. 24 Увеличились размеры полушарий головного мозга, промежуточный мозг отодвигался назад. 1
• Кровеносная система. 4 Двухкамерное сердце рыб превратилось в трёхкамерное у амфибий и рептилий, а потом и в четырёхкамерное у млекопитающих. 4
• Органы дыхания. 4 Увеличилась дыхательная поверхность лёгких: от мешковидных у амфибий до альвеолярных у млекопитающих. 4
• Система выделения. 2 Эволюция шла в направлении создания специализированных органов, обеспечивающих выведение из организма образующихся в процессе жизнедеятельности опасных, а иногда просто ядовитых веществ. 2
• Роль хвостового отдела позвоночника. 1 У млекопитающих хвост стал органом терморегуляции. 1 Вторично у некоторых млекопитающих хвост может выполнять функции движителя, парашюта, балансира, органа опоры, захвата, коммуникации и другие. 1