Эволюционные взаимоотношения между таксонами влияют на таксономическую последовательность следующим образом: в эволюционной систематике классифицированию предшествует рисование филогенетических деревьев, а система таксонов возникает как результат нарезания дерева на фрагменты, соответствующие его ветвям разного порядка. 1

Например, полное отражение эволюционной схемы в классификации достигается приданием сестринским группам одинакового таксономического ранга и фиксированием каждого ветвления в виде таксона более высокого ранга, чем ранг пары сестринских групп, образовавшихся в результате этого ветвления. 3

Также в геносистематике родственные отношения реконструируются по строению белка, ДНК, РНК, которым приписывается больший вес, чем данным классической морфологии. 1 Это позволяет выделять и ранжировать таксоны по количеству различающих их геномных перестроек, которые трактуются как мера времени их эволюционного расхождения. 1