Процессы органогенеза в разных группах организмов эволюционно менялись следующим образом:

• У хордовых на этапе органогенеза происходит закладка нервной трубки, хорды и кишечной трубки. 1 Вдоль верхней части зародыша часть эктодермы погружается в полость тела, образуя нервный желоб (гребень). 1 Края гребня замыкаются, отделяются от эктодермы и превращаются в нервную трубку. 1 Передняя часть трубки в дальнейшем разрастается и даёт начало головному мозгу, а остальная становится спинным мозгом. 1 Одновременно с верхней стороны энтодермальной трубки отделяется группа клеток, которые покрываются эластичной оболочкой из соединительной ткани и образуют хорду. 1 На её основе в дальнейшем формируется позвоночник. 1
• У двухслойных животных (губок и кишечнополостных) на стадии гаструлы (двух зародышевых листков) развитие прекращается. 2 У всех остальных животных развитие продолжается, и образуется третий зародышевый листок — мезодерма. 2 Из неё формируются все виды мышечной и соединительной ткани, кровеносная система, органы выделения, половые железы. 2

Таким образом, процессы органогенеза в разных группах организмов отличаются особенностями формирования определённых органов и систем органов 125.