Эволюционное развитие и связи бандикутов с другими группами сумчатых остаются загадкой. 24
Некоторые черты, которые обособляют бандикутов от остальных сумчатых:
По результатам одного из исследований, сумчатые кроты являются сестринской группой по отношению к бандикутам, при этом клада, к которой относятся сумчатые кроты и бандикуты, находится в сестринских взаимоотношениях с хищными сумчатыми. 3
Существуют также гипотезы о родстве сумчатых кротов с двурезцовыми или хищными сумчатыми. 3