Эволюционная биология и онтогенез связаны между собой через область эволюционной биологии развития (evo-devo). 35 Она сравнивает онтогенез различных организмов, устанавливает родственные связи между ними и вскрывает развитие онтогенетических процессов в ходе эволюции. 3

Концепция evo-devo предполагает, что эволюция изменяет процессы индивидуального развития. 3 Она создаёт новые и даже новаторские структуры на основе старых генных сетей (например, костная структура челюсти дала начало строению слуховых косточек среднего уха) или сохраняет похожие программы развития во множестве различных организмов (например, генное регулирование развития глаза сходно у моллюсков, членистоногих и позвоночных). 3

Также в рамках этой области рассматривается, как изменения в онтогенетическом развитии приводят к возникновению новых признаков, роль фенотипической пластичности в эволюции, как экология влияет на развитие и эволюционные изменения. 3