Определение молекулы эволюционировало с течением времени по мере расширения знаний о структуре молекул. 1

Более ранние определения были менее точными и определяли молекулы как мельчайшие частицы чистых химических веществ, которые всё ещё сохраняют свой состав и химические свойства. 1

В 1860 году на международном съезде химиков в Карлсруэ были приняты определения понятий молекулы и атома. 2 Молекула была определена как наименьшая частица химического вещества, обладающая всеми его химическими свойствами. 2

В классической теории химического строения молекула рассматривается как наименьшая стабильная частица вещества, обладающая всеми его химическими свойствами. 2 В этом определении к молекулам относятся и одноатомные частицы (в частности, молекулы инертных газов). 2