Как эволюционировали методы изучения транскриптома с начала 1990-х годов?

С начала 1990-х годов методы изучения транскриптома эволюционировали, и в конце того периода транскриптомика стала важной биологической наукой. ru.wikipedia.org Некоторые этапы развития:

• Появление сериального анализа экспрессии генов (SAGE). ru.wikipedia.org ru.ruwiki.ru В 1995 году был разработан метод, основанный на секвенировании, который заключался в секвенировании по Сэнгеру соединённых фрагментов случайных транскриптов. ru.wikipedia.org ru.ruwiki.ru Количество транскриптов оценивалось по числу совпадений с фрагментами известных генов. ru.wikipedia.org
• Разработка микрочипов. ru.wikipedia.org {10-host} В 1995 году появились публикации по этому методу, который измерял относительное содержание определённых транскриптов за счёт их гибридизации с комплементарными пробами, нанесёнными на микрочип. ru.wikipedia.org Метод позволял одновременно исследовать тысячи транскриптов, что снижало стоимость исследования транскриптома в расчёте на ген и экономило усилия. ru.wikipedia.org
• Развитие технологий создания микрочипов. ru.wikipedia.org Улучшения привели к увеличению специфичности проб и количества генов, которые можно проанализировать с помощью одного чипа. ru.wikipedia.org Благодаря новым методам детекции флуоресценции стало возможным точно определять наличие и количество даже транскриптов, синтезируемых на низком уровне. ru.wikipedia.org
• Появление секвенирования РНК (РНК-Seq). ru.wikipedia.org ru.ruwiki.ru На этот метод оказало влияние развитие методов секвенирования нового поколения. ru.wikipedia.org РНК-Seq подразумевает секвенирование кДНК, соответствующей транскриптам, причём численность отдельных фрагментов кДНК определяется численностью соответствующих транскриптов. ru.wikipedia.org
• Попытки получения транскриптомных данных для отдельных клеток. ru.ruwiki.ru Это стимулировало совершенствование методов приготовления библиотек для РНК-Seq, что значительно увеличило чувствительность технологии. ru.ruwiki.ru Появились методы РНК-Seq in situ, в которых транскриптомы отдельных клеток были получены непосредственно в фиксированных тканях. ru.ruwiki.ru