Механизмы образования и развития зигот у организмов разных царств имеют свои особенности:

• Грибы. У грибов зигота может вступать в мейоз или митоз в зависимости от жизненного цикла вида. 2
• Растения. У растений зигота может быть полиплоидной, если оплодотворение происходит между мейотически редуцированными гаметами. 2 У наземных растений зигота образуется в камере — архегониуме. 2 По мере того как зигота делится и растёт, она делает это внутри архегония. 2
• Одноклеточные организмы. В них зигота может делиться бесполым путём путём митоза для получения идентичного потомства. 2

У животных процесс эмбриогенеза начинается с зачатия — оплодотворения женской гаметы — яйцеклетки мужской гаметой — сперматозоидом. 3 Оплодотворённая яйцеклетка формирует зиготу — единственную диплоидную клетку нового живого организма. 3 В благоприятных условиях зигота затем проходит несколько последовательных митотических делений, без существенного роста общего объёма или массы образовавшихся клеток. 3 Этот процесс называется дроблением и приводит к образованию многоклеточного зародыша. 3 Затем начинаются процессы дифференцировки клеток, благодаря которым зародыш становится многослойным. 3

В неблагоприятных условиях у многих видов живых существ зигота на ранних стадиях впадает во временную «спячку», временно прекращая дальнейшее развитие. 3