Эпигенетические механизмы влияют на развитие организма из зиготы следующим образом:

• Определяют симметричность организма. 1 С помощью эпигенетики можно точно определить, в какую сторону будет расти голова и в какую — ноги. 1
• Регулируют равномерное смешивание материнского и отцовского геномов в зародыше. 1 На стадии зародыша в 50–100 клеток в каждой клетке хромосома (отцовская или материнская) отключается метилированием и уже остаётся неактивной при дальнейшем развитии клетки. 1
• Определяют, какие клетки станут сердечной мышцей, печенью или мозгом. 3 Зародыш на стадии первичного развития состоит из универсальных эмбриональных клеток, и эпигенетическое регулирование генома определяет, какая клетка или ткань начнёт формироваться и где именно. 1

Кроме того, эпигенетические изменения могут быть переданы от одного поколения к другому. 3 Например, материнский режим питания и образ жизни во время беременности может влиять на метилирование генов у потомства и иметь долгосрочные последствия для его здоровья. 3