Электронное и пространственное строение пептидной группы влияет на укладку полипептидной цепи в пространстве и, прежде всего, предопределяет формирование вторичной структуры белка. 1

С позиций электронного строения пептидная группа представляет собой трёхцентровую р––сопряжённую систему, электронная плотность в которой смещена в сторону более электроотрицательного атома кислорода. 1 Это увеличивает способность атомов к образованию водородной связи, за счёт которой возникает важнейшее свойство белков — образовывать структуры бесконечно разнообразных форм. 1

Пространственное строение пептидной группы задаёт достаточно жёсткую плоскую структуру, поскольку связь С–N имеет характер частично двойной, вращение заместителей вокруг неё сильно ограничено. 2 В составе полипептидной цепи жёсткие структурные элементы (плоские пептидные группы) чередуются с относительно подвижными участками, которые способны вращаться вокруг связей. 1

Таким образом, электронное и пространственное строение пептидной группы влияет на укладку полипептидной цепи в пространстве и определяет её пространственную ориентацию. 1