Экзоны связаны с развитием новых генов и белков в процессе эволюции тем, что являются первичными генетическими единицами, перекомбинация которых приводит к возникновению новых генов и соответственно новых белков. 23

Происходит это различными способами: экзоны внутри гена могут теряться, дублироваться или даже объединяться с экзонами других генов для создания нового химерного гена. 1