Эффект основателя повлиял на эволюцию человека и других организмов следующим образом: когда новая популяция создаётся небольшим числом особей из исходной популяции, это приводит к уменьшению генетического разнообразия и случайному сдвигу частот аллелей относительно исходной популяции. 3

Для человека эффект основателя позволяет объяснить влияние родительского генетического материала на возникновение ряда наследственных заболеваний или уникальных черт в изолированных общностях — например, у переселенцев на новых территориях. 3 Например, самое большое генетическое разнообразие наблюдается у африканцев — своего рода исходной популяции, а у всех остальных генофонд менее разнообразен, что говорит о наличии единого предка, вышедшего из Африки. 5

Для других организмов эффект основателя может способствовать видообразованию, но также и полному исчезновению популяции из-за отсутствия генетического разнообразия. 1 Например, современные учёные полагают, что многообразие видов на Земле, в частности, в морях и океанах, в какой-то мере обусловлено именно эффектом основателя. 1