В долгосрочной перспективе дрейф генов влияет на разнообразие популяций следующим образом:

• Снижает генетическое разнообразие. 5 Как только аллель теряется в результате дрейфа, он больше не существует в популяции (если только не возникает вновь в результате мутации или не поступает из другой популяции в результате миграции). 5
• Увеличивает генетическую дифференциацию между популяциями. 5 Дрейф генов вызывает потерю определённых генов или их аллелей в популяции, что усиливает различия между различными малочисленными популяциями и, таким образом, приводит к видообразованию. 5

Такой эффект особенно заметен в небольших популяциях, где случайные изменения могут существенно повлиять на всю генетическую структуру. 2