Динамическое программирование применяется в биоинформатике и вычислительной биологии для решения различных задач: 1

• поиск гомологии белка; 1
• предсказание структуры гена; 1
• поиск мотивов; 1
• анализ повторяющихся элементов генома; 1
• предсказание вторичной структуры РНК; 1
• интерпретация данных масс-спектрометрии. 1

Например, для получения парного выравнивания, то есть оценки сходства двух последовательностей, используются различные модификации алгоритма динамического программирования (алгоритм Нидлмана — Вунша, алгоритм Смита — Ватермана и другие). 5

Также динамическое программирование помогает в изучении развития клеток, например, для предсказания развития организма и создания лекарств. 2