Дифференцировка клеток влияет на формирование различных тканей и органов в процессе органогенеза следующим образом: менее специализированные клетки становятся более специализированными за счёт экспрессии определённого набора генов. 2

В формировании различных тканей и органов участвуют различные зародышевые листки: 2

• Из эктодермы образуются нервная ткань, элементы органов чувств, внешний слой покровов (эпидермис) и кожные железы, передняя и задняя кишки, составляющие желёз внутренней секреции (надпочечников и т. д.). 2
• Из энтодермы образуется эпителиальная ткань, из которой впоследствии образуются слизистые, лёгкие, капилляры и железы (кроме половых и кожных). 2
• Из мезодермы образуются мышечная и соединительная ткань, хорда. 2

Таким образом, дифференцировка клеток определяет, какие структуры и функции будут развиваться из каждого зародышевого листка. 24