Цисты простейших положительно влияют на экосистемы, обеспечивая выживаемость вида и его расселение. 3

В состоянии цисты простейшие переносят неблагоприятные условия, например зимние холода или пересыхание водоёмов. 3 При попадании в благоприятные условия цисты прорастают, при этом их содержимое выходит из оболочки. 1

Кроме того, простейшие служат источником пищи для многих животных, составляют часть зоопланктона и являются важной пищей для животных, живущих в водоёмах. 25 Также они участвуют в разложении органических материалов и способствуют круговороту веществ. 5

У паразитических форм циста покоя обеспечивает переход от одного организма-хозяина к другому через внешнюю среду. 1