Цис- и транс-изомеры влияют на биологические процессы в живых организмах следующим образом:

• Влияют на структуру белков. 1 Цис-транс-изомеризация влияет на структуру белка, и такое изменение может играть важную роль в регуляции биохимических процессов. 1 Например, для активной формы белка иногда необходима не транс-конформация, которая образуется при синтезе, а цис-конформация. 1
• Определяют действие ферментов. 3 Расположение радикалов по отношению к двойной связи между двумя атомами углерода влияет на активность ферментов. 3 Например, фермент L-аспартат-аммиак-лиаза (аспартаза) действует только на фумаровую кислоту (транс-изомер), совершенно не реагируя с малеиновой кислотой (цис-изомер). 3
• Участвуют в фоторецепции. 5 Цис-транс-фотоизомеризация лежит в основе фоторецепции: одного кванта видимого света достаточно, чтобы молекула транс-ретиналя — вещества, находящегося в зрительном рецепторе, превратилась в цис-изомер. 5 Это вызывает каскад последующих биохимических превращений, в результате чего и формируется соответствующий нервный импульс. 5