Чистота линии растений влияет на селекцию и выведение новых сортов следующим образом:

• Обеспечивает генетическую однородность. 13 Все особи в пределах чистой линии имеют идентичный генотип, и любая вариация возникает только из-за окружающей среды. 1 Это позволяет селекционерам работать с однородными сортами, которые больше нравятся фермерам и потребителям. 1
• Позволяет закрепить желаемые признаки. 2 Чистые линии необходимы для наследственного закрепления ценных признаков, а также для проведения межлинейного скрещивания. 2
• Способствует повышению урожайности. 5 Для этого используется явление гетерозиса — резкое усиление продуктивности организмов первого поколения, которое было получено в результате скрещивания особей чистых линий. 5

Однако у метода отбора чистых линий есть и недостатки: такие сорта не обладают широкой адаптацией и стабильностью в производстве. 1 Кроме того, процедура отбора требует времени, пространства и более дорогостоящих испытаний на урожайность. 1