Бромфеноловый синий помогает выявлять и определять белки в тканях благодаря свойству красителя связываться с белками. 3

В кислой среде раствор бромфенолового синего имеет жёлтый цвет и максимум поглощения при 440 нм. 3 При связывании красителя с белками катионная форма красителя изменяется на анионную, имеющую синюю окраску, а максимум поглощения сдвигается до 597 нм. 3

Количество связанного бромфенолового синего в срезах препаратов пропорционально содержанию в них белков, что позволяет проводить количественный фотометрический анализ на содержание белков в тканях. 2

Реакция позволяет обнаружить белки и в структурах, содержащих нуклеиновые кислоты: после их удаления окраска усиливается. 2 Белки при этом приобретают тёмно-фиолетовую окраску. 2