Бластоцель влияет на миграцию клеток в эмбриональном развитии следующим образом: он обеспечивает миграцию клеток во время гаструляции и предотвращает преждевременное взаимодействие клеток под бластоцелем с клетками над ним. 2

Например, бластоцель предотвращает контакт растительных клеток, которым суждено стать энтодермой, с теми клетками эктодермы, которым суждено дать начало коже и нервам. 2

Также важную роль в миграции клеток внутри бластоцеля, особенно у высших позвоночных (птиц и млекопитающих), играет гиалуроновая кислота. 1 Она накапливается в бластоцеле, покрывая сплошным слоем поверхность вступающих в бластоцель клеток и поддерживая их в диспергированном состоянии за счёт способности значительно увеличивать свой объём в воде. 1