Биоинформатика помогает в предсказании пространственной структуры биополимеров, таких как белки, ДНК и РНК, с помощью алгоритмов и программ. 2
Некоторые способы, как это происходит:
- Сравнительный подход. 2 Программа делает предсказания, исходя из допущения, что «родственные» по составу белки сворачиваются в одну и ту же структуру. 2
- Статистический подход. 2 Программа «выстраивает» пространственную структуру целого белка из небольших отдельных фрагментов, зная, какую форму обычно приобретают те или иные аминокислотные последовательности. 2
- Распознавание укладки. 4 Программа ищет аминокислотную последовательность, для которой неизвестна структура, в базе данных известных структур. 4
- Предсказание взаимодействия молекул. 1 Основываясь на 3D-структурах взаимодействующих молекул и их физических свойствах, можно предсказать места контакта или связывания этих молекул, рассчитать характеристики связывания. 1
Биоинформатика позволяет без каких-либо экспериментальных процедур с высокой точностью ответить на вопрос, как в действительности выглядит белковая молекула. 2