Биогеография помогает в изучении и охране редких и эндемичных видов следующим образом:

• Выявляет районы с высоким биоразнообразием и эндемизмом и оценивает воздействие деятельности человека. 2 Это позволяет определить приоритетные области для сохранения видов, находящихся под угрозой исчезновения, и поддержания экологических связей. 2
• Помогает в создании охраняемых территорий и разработке стратегий сохранения биоразнообразия, а также в восстановлении среды обитания. 2
• Изучает ареалы различных таксонов, в том числе эндемичных, что является одним из методов флористического и фаунистического районирования. 3
• Раскрывает историю формирования видового состава сообществ и позволяет выявить родственные связи видов, обитающих в разных областях суши. 5