Бактерии участвуют в образовании строматолитов через деятельность бактериальных матов — сложных сообществ микроорганизмов, ведущую роль в которых играют цианобактерии. 1

Некоторые процессы, которые происходят с участием бактерий:

• Усвоение углекислого газа. 1 Цианобактерии превращают его в кислород и органические вещества, которыми питаются другие микроорганизмы, входящие в сообщество. 1
• Улавливание твёрдых частиц. 15 Если внутрь бактериального мата попадает песок или другие твёрдые частицы, они цементируются и откладываются снизу в виде каменных корочек. 1
• Влияние на форму строматолитов. 4 Нитевидные цианобактерии могут улавливать и связывать осадочные частицы, и в зависимости от длины нитей размер захваченных частиц варьируется. 4
• Формирование конической формы. 4 Тонкие нитевидные цианобактерии образуют маленькие колбочки в ответ на свет, даже в отсутствие литификации. 4
• Выработка кислорода. 4 Кислород, который вырабатывают цианобактерии на кончиках литифицирующих конусов, вызывает образование искривлённых пластинок, в которых могут задерживаться пузырьки кислорода. 4

Со временем толщина этих слоистых образований растёт, и так появляется строматолит. 1