Бактерии регулируют упаковку своей ДНК в нуклеоиде с помощью специальных белков, которые поддерживают необходимый уровень суперспирализации и компактизации. 1

Некоторые из таких белков:

• Топоизомеразы. 1 Контролируют суперспирализацию ДНК, которая играет важную роль в её компактизации. 1 Также обеспечивают протекание таких процессов, как репликация и транскрипция, для которых требуется раскручивание молекулы ДНК. 1
• Белки семейства SMC. 1 Поддерживают структурную организацию нуклеоида, но конкретный механизм их участия остаётся неясным. 1
• ДНК-связывающие белки (NAPs). 3 Вызывают локальную деформацию или изгиб ДНК. 3

Организация ДНК в нуклеоиде различна в разных клетках. 4 Например, при стрессе голодания бактерии задействуют энергонезависимый механизм поддержания упорядоченности и защиты ДНК — создание устойчивых молекулярных структур. 24

В среднем степень упаковки бактериальной ДНК варьирует от сотни до тысячи раз. 5