Бактерии могут получать энергию без использования кислорода (анаэробно) за счёт различных процессов: 1

• Сульфатное дыхание. 1 Конечным акцептором электронов являются соли серной кислоты — сульфаты (SO42-). 1 Донорами электронов могут служить молекулы угарного газа (СО), водорода и органических веществ. 1
• Нитратное дыхание. 1 В качестве конечного акцептора электронов выступают соли азотной кислоты — нитраты (NO3-). 1 Донорами электронов могут быть молекулы водорода и различных органических веществ. 1
• Железное дыхание. 1 Процесс переноса электрона по электрон-транспортной цепи на ион трёхвалентного железа (Fe3+) с восстановлением до двухвалентного железа (Fe2+) с выделением энергии. 1 Помимо железа в качестве акцептора электронов микроорганизмы способны использовать марганец, кобальт, а также некоторые соединения металлов. 1
• Карбонатное дыхание (метаногенез). 1 Процесс передачи электронов по электрон-транспортной цепи с использованием в качестве конечного акцептора электронов молекул углекислого газа (СО2), угарного газа (CO) или окисленных органических соединений, таких как ацетат (CH3COOH). 1

Также анаэробные организмы могут получать энергию путём катаболизма аминокислот и их соединений (пептидов, белков). 5