Апомиксис по-разному влияет на генетическое разнообразие популяций растений. 3

С одной стороны, он формирует клональное потомство, генетически идентичное материнскому растению. 3 Это позволяет фиксировать сложные генотипы и сохранять комплексы ценных приобретённых признаков в неограниченном ряду поколений. 3

С другой стороны, апомиксис способствует размножению полиплоидов. 4 Они могут иметь преимущества в борьбе за существование, так как несут различные аллельные варианты генов. 4

Также апомиксис может увеличивать генетическое разнообразие, поддерживая редкие аллели. 1 Например, сравнительный изозимный анализ диплоидных половых и тетраплоидных апомиктичных популяций Panicum maximum продемонстрировал, что апомиксис не сокращает разнообразие, а наоборот, редкие аллели, подверженные сильному отбору на диплоидном (половом) уровне, поддерживаются при апомиксисе. 1