Андрогенез используется в селекции растений для ускорения процесса получения новых сортов, повышения эффективности генетических исследований и расширения существующего генофонда. 5

Метод андрогенеза позволяет:

• Получать константные, нерасщепляющиеся гомозиготные формы. 5 Для их получения традиционными методами гибридизации и отбора требуется длительный инбридинг. 5 С помощью культуры пыльников от гибридных растений первого поколения, родители которых различались по ряду признаков, можно получать гомозиготные растения в первой генерации и сократить селекционный процесс на 3–4 генерации, необходимые для обычной схемы селекции. 5
• Создавать ядерно-цитоплазматические гибриды или аллоплазматические линии. 3 Создание таких линий значительно повышает эффективность селекционного процесса. 3
• Выявлять и изучать вклад ядра и цитоплазмы в проявление генотипических и фенотипических признаков. 3 Цитоплазматические факторы влияют на многие важнейшие признаки: иммунитет, длину вегетационного периода, продуктивность, устойчивость к биотическим и абиотическим факторам, скороспелость и другие. 3