Амебы помогают очищать водоёмы, регулируя численность бактериальных организмов в озёрах и прудах, а также очищая водную среду от чрезмерного загрязнения. 1

Амебы поглощают различные мелкие объекты, такие как одноклеточные водоросли, бактерии и других простейших, что способствует удалению загрязнений. 1

Кроме того, амебы выступают в роли индикаторов чистоты воды: их количество в водоёме может указывать на степень загрязнения: при плохой очистке воды амеб больше, а в чистых водоёмах их мало или нет вовсе. 3