How spike-in controls can improve DNA sequence analysis accuracy?

Использование spike-in-контроля позволяет улучшить точность анализа ДНК-последовательностей несколькими способами:

• Нормализация данных. pmc.ncbi.nlm.nih.gov Spike-in-контроль добавляют в количестве, пропорциональном числу клеток, чтобы можно было точно определить, увеличивается или уменьшается сигнал в каждом регионе генома между образцами. pmc.ncbi.nlm.nih.gov
• Коррекция технических эффектов. www.biorxiv.org Spike-in-контроль помогает устранить искажения, связанные с биофизическими свойствами фрагментов ДНК и другими техническими факторами. www.biorxiv.org
• Выявление ошибок. www.nature.com Spike-in-контроль проходит вместе с образцами через весь аналитический процесс, что позволяет обнаружить возможные ошибки и перекрестное загрязнение. www.nature.com
• Оценка эффективности экстракции. www.revvity.com В зависимости от того, когда добавляют spike-in-контроль, можно оценить эффективность экстракции. www.revvity.com
• Помощь в сравнении данных. www.revvity.com В крупных проектах или клинических исследованиях spike-in-контроль помогает согласовать данные, полученные в разных лабораториях или на разных платформах. www.revvity.com
• Возможность построения калибровочных кривых. www.revvity.com Spike-in-контроль позволяет оценить абсолютное количество копий эндогенных малых РНК, что важно, когда уровень малых РНК существенно отличается в разных условиях. www.revvity.com