В природе кладофора растёт в водоёмах Северного полушария с прохладной водой (температура не выше 22 градусов) на всей территории Евразии, от Тихого до Атлантического океана. 2
Чаще всего кладофору можно встретить на дне рек и озёр Японии и Исландии. 2 Она предпочитает пресную воду, но встречается и в умеренно солёных водоёмах. 2
Некоторые места, где можно увидеть кладофору в естественном ареале обитания: озеро Акан, озеро Миватн на севере Исландии, остров Хоккайдо. 4