Мох кукушкин лён предпочитает расти на влажных почвах, в низинках, около болот, в хвойных лесах, особенно ельниках. 1
В России он наиболее распространён в лесах северной и средней полосы. 5 Также встречается в тундре и в горной местности. 5
Кукушкин лён любит свет, поэтому в тёмных ельниках он не будет высоким. 25