Согласно одной из моделей внутреннего строения Юпитера, под облаками находится слой смеси водорода и гелия толщиной около 21 тыс. км с плавным переходом от газообразной к жидкой фазе. 1 Затем следует слой жидкого и металлического водорода глубиной 30–50 тыс. км. 1 Внутри может находиться твёрдое ядро диаметром около 20 тыс. км. 1

Предполагаемая толщина слоя металлического водорода — 42–46 тыс. км. 2 Мощные электротоки, возникающие в этом слое, порождают гигантское магнитное поле Юпитера. 1

Также существует модель, согласно которой в недрах планеты находится металлический гелий, образующий своеобразный сплав с металлическим водородом. 1

Химический состав внутренних слоёв Юпитера невозможно определить современными методами наблюдений. 1