В состав комплекса Гольджи входят:

• Сплющенные дискообразные цистерны (диктиосомы) в виде многоярусной системы, которые плотно располагаются пучками на расстоянии от 14 до 25 нм с внутренним пространством от 5 до 20 нм. 12 Обычно в одном комплексе находится 5–6 мешочков. 1
• Система трубочек диаметром 20–50 нм. 2
• Система пузырьков (везикул). 12 Размеры мелких пузырьков (везикул) — 20–30 нм, а больших — до 2000 нм. 1

Внутреннее межмембранное пространство заполнено матриксом, который содержит специфические ферменты. 2