Разделение культур микроорганизмов на несколько типов, отличающихся друг от друга, называется дифференциацией. 3

Первично выделенная из каких-либо источников (воды, почвы, воздуха или других сред) культура обычно неоднородна по видовому составу организмов и называется смешанной. 1 Исследования, проводимые на смешанных культурах, позволяют, например, оценить формы взаимодействия микроорганизмов в местах их естественного обитания. 1

Чистые культуры микроорганизмов — это популяции клеток или многоклеточных организмов, растущих в отсутствие других видов. 2 Они необходимы для изучения физиологических и биохимических особенностей микроорганизмов. 1

Консорциумы — смешанные или ассоциативные культуры, состоящие из двух и более микроорганизмов, между которыми существуют различные формы взаимоотношений. 4 Различают три основных типа консорциумов микроорганизмов: искусственно созданные смеси микроорганизмов, консорциумы, выделенные непосредственно из природных источников, и консорциумы, образовавшиеся в результате практической деятельности человека (например, закваски). 4

Штаммы — чистые культуры микроорганизмов одного вида, выделенные из различных источников. 45 Они могут отличаться друг от друга незначительным отклонением морфологических, культуральных или биохимических признаков, не выходя за пределы своего вида или подвида. 5