Приставка микро- имеет несколько значений:

1. Указывает на малые размеры или малую величину чего-либо. 3 Например: микроорганизм, микросистема, микроструктура. 2
2. Обозначает дольную единицу измерения, составляющую одну миллионную долю от исходной единицы. 12 Например: микрометр, микросекунда. 2
3. Указывает на связь с изучением или измерением очень малых предметов, величин, явлений. 2 Например: микроанализ, микробиология. 2

Также приставка микро- может образовывать существительные со значением того же, что и мотивирующее имя существительное, но значительно меньшей или минимальной величины. 1 Например: космос → микрокосмос, мир → микромир, система → микросистема. 1