Световой микроскоп позволяет увидеть, например: срезы тканей, бактерии, крупные структуры (ядро, хлоропласты, митохондрии), деление клеток. 1 Такой микроскоп можно использовать для изучения живых образцов, так как свет не наносит им вреда. 5

Электронный микроскоп даёт возможность рассмотреть:

• мелкие органоиды, например, рибосомы; 1
• ультраструктуру органоидов (кристы митохондрий, граны хлоропластов). 1

Электронный микроскоп используется для исследования неживых объектов и материалов, так как для его работы необходим вакуум, а живые клетки вакуумная среда и электронный луч могут повредить или уничтожить. 45

Таким образом, световой микроскоп подходит для обзорного изучения живых и неживых образцов с ограниченным разрешением и увеличением, а электронный микроскоп предназначен для исследований на наноуровне, где требуется высокое разрешение и увеличение. 5