Некоторые отличия японской лиственницы от других видов лиственницы:

• Ветви. 1 У японской лиственницы они слегка закручены по спирали. 1
• Хвоя. 1 У этого вида она средней длины: от 15 до 50 мм, тупая, сизого или сизо-зелёного оттенка. 1
• Шишки. 1 Они имеют округло-овальную форму, длиной 20–35 мм, состоят, как правило, из 45–50 чешуек, расположенных в 5–6 рядов. 1
• Переносимость затенения. 1 В отличие от других лиственниц, японский вид лучше переносит затенение. 1
• Требовательность к освещению и почве. 3 Японская лиственница более требовательна к освещению и почве, чем другие виды. 3