TPM (число транскриптов на килобазу на миллион) отличается от других методов нормализации данных тем, что учитывает длину гена. 13

При использовании TPM число прочтений делят на длину транскрипта в килобазах на миллион прокартированных ридов. 1 Метод позволяет сравнивать число прочтений для генов внутри образца или между образцами из одной группы. 1

В то время как другие методы, например CPM или RPKM/FPKM, учитывают только глубину секвенирования, TPM учитывает и длину гена. 13 Кроме того, при использовании TPM сумма всех значений для каждого образца остаётся одинаковой, что удобно для сравнения доли прочтений, сопоставленных с геном, в каждом образце. 2