Чем TPM отличается от других методов нормализации данных?

TPM (число транскриптов на килобазу на миллион) отличается от других методов нормализации данных тем, что учитывает длину гена. foreverstas.github.io www.reneshbedre.com

При использовании TPM число прочтений делят на длину транскрипта в килобазах на миллион прокартированных ридов. foreverstas.github.io Метод позволяет сравнивать число прочтений для генов внутри образца или между образцами из одной группы. foreverstas.github.io

В то время как другие методы, например CPM или RPKM/FPKM, учитывают только глубину секвенирования, TPM учитывает и длину гена. foreverstas.github.io www.reneshbedre.com Кроме того, при использовании TPM сумма всех значений для каждого образца остаётся одинаковой, что удобно для сравнения доли прочтений, сопоставленных с геном, в каждом образце. www.novogene.com