Технопарк и Академгородок отличаются по своим целям и задачам.

Технопарк — это комплексный технологический парк, призванный создать условия для зарождения и развития инновационных компаний и успешного развития действующих инновационных предприятий. 3 Он ориентирован на внедрение научно-технологических разработок путём коммерциализации накопленного научного знания. 1

Академгородок — это научный центр, в котором размещаются научно-исследовательские и проектные институты различной отраслевой направленности. 1 Отличием советских научных центров вроде Академгородка от западных технопарков состояло в том, что они были ориентированы преимущественно не на рыночный спрос, а на решение чётко поставленных отраслевых задач плановой экономики. 1

Таким образом, основное отличие в том, что технопарк направлен на развитие инновационной экономики и внедрение научных разработок, в то время как Академгородок ориентирован на научные исследования и решение отраслевых задач.