Смысловые вопросы и падежные отличаются по цели их использования в русском языке.

Падежные вопросы нужны для определения падежа имени существительного, чтобы правильно написать его окончание. 2 Примеры падежных вопросов: именительный — кто? / что?, родительный — кого? / чего?, дательный — кому? / чему?, винительный — кого? / что?, творительный — кем? / чем?, предложный — о ком? / о чём?. 4

Смысловые вопросы предназначены для определения синтаксической функции существительного в предложении, то есть того, каким членом предложения оно является: обстоятельством, дополнением, определением и т. д.. 2 Обычно смысловые вопросы нужны, чтобы определить вид обстоятельства: где, в каком месте?, когда, в какое время?, как, каким образом?, почему?, по какой причине?. 1

Таким образом, падежные вопросы фокусируются на определении грамматической формы существительного, а смысловые — на его роли в предложении.